工程鲫鱼和鲫鱼是两种不同的鱼类，它们在外形、生态习性和利用价值等方面都存在着一些区别。

首先，工程鲫鱼是一种人工培育的鱼类，它是通过人工繁殖和养殖产生的品种，以其生长速度快、肉质鲜美、适应性强等优点而受到广泛的关注和应用。而鲫鱼则是一种天然生长的鱼类，它们生长在淡水湖泊、河流和水库等自然水域中，以其肉质鲜美、营养丰富等特点为人所喜爱。

其次，从外形上来看，工程鲫鱼和鲫鱼存在一定的差异。工程鲫鱼体型较大，肉质肥厚，身体颜色多为白色或淡黄色，背鳍和臀鳍较长。而鲫鱼则体型相对较小，身体颜色多为灰褐色或深灰色，背鳍和臀鳍较短。

最后，工程鲫鱼和鲫鱼在利用价值上也存在一些区别。工程鲫鱼是一种优良的食用鱼类，不仅味道鲜美，而且富含营养，是人们日常生活中的重要食材。同时，工程鲫鱼还具有很高的经济价值，是渔业生产中的重要品种。而鲫鱼则不仅可以作为食用鱼类，还具有较高的观赏价值，是水族馆等场所中常见的展示品种。

综上所述，工程鲫鱼和鲫鱼虽然都属于鲤科鱼类，但是它们在外形、生态习性和利用价值等方面都存在着一定的区别，我们需要根据具体的情况选择不同的鱼类进行培育或利用。