蓝藻和裸甲藻是两种常见的淡水藻类，它们在形态、结构和生态习性上有一些明显的差异。

首先，从外观上来看，蓝藻和裸甲藻的形态差异很明显。蓝藻通常是形成细长的丝状体或片状体，其大小和形状不一，但都有一定的弹性和韧度；而裸甲藻则通常是形成半球形或凸起的簇状体，其大小和形状也不一，但通常比蓝藻更加脆弱。

其次，从结构上来看，蓝藻和裸甲藻的差异也比较明显。蓝藻的细胞壁较为坚硬，由多层薄膜和多种不同的化合物组成，可以有效地保护细胞内部结构和物质的稳定；而裸甲藻的细胞壁较为薄弱，常常因为外部环境的变化而发生破裂或变形。

最后，从生态习性上来看，蓝藻和裸甲藻也有一些不同。蓝藻可以在各种水体中生长和繁殖，其光合作用产生的氧气可以有效地维持水体中的氧气含量；而裸甲藻则更适合在湖泊、河流等静水环境中生长，其生长速度较慢，但对于水体中的营养物质需要量较小。

综上所述，蓝藻和裸甲藻虽然都是淡水藻类，但在形态、结构和生态习性上都有一些明显的差异。熟悉这些差异，可以帮助我们更好地认识和理解这些重要的生物群体。