吉林大学珠海校区和吉林大学主校区是同属于吉林大学，但两个校区有很大的不同。

首先，吉林大学珠海校区位于广东省珠海市，而吉林大学主校区位于吉林省长春市。这两个地理位置的差异导致了许多方面的不同。

其次，吉林大学珠海校区是一个新建的校区，建设时间不长，校园环境和设施相对较新。而吉林大学主校区建立于1946年，是一所历史悠久的大学。因此，两个校区的学校氛围、建筑风格、校园文化等都有很大的区别。

此外，两个校区的专业设置也有所不同。吉林大学主校区拥有更多的专业，涵盖了不同学科领域，如理、工、医、文、法等。而吉林大学珠海校区则更注重工科和商科的发展。

总而言之，尽管吉林大学珠海校区和吉林大学主校区都是吉林大学的一部分，但它们之间仍然有许多不同之处，包括地理位置、校园环境、学校氛围、文化氛围以及专业设置等。