南京国税局的上班时间是早上8点半至下午5点半，中午12点至1点为午休时间。周一至周五上班，周六、周日为休息日。在国家法定节假日和单位规定的公休日，国税局也不开展工作。需要注意的是，国税局的具体上班时间以及休息日可能会受到节假日等因素的影响而有所调整，请关注相关通知。此外，南京国税局还提供了便捷的网上办税服务，方便纳税人随时随地进行税务申报和查询。