《汉尼拔》第二季共有13集，以下是各集的剧情介绍：

第一集：《Kaiseki》

第二季开篇，威拉与汉尼拔在欧洲度假，却被一起发现的杀人事件所打断。杀人犯使用的是汉尼拔的烹饪方法，因此，威拉又被卷入了一场犯罪之中。

第二集：《Sakizuke》

威拉成为了联邦调查局的嫌疑对象，而汉尼拔却在背后操纵一切。在此情况下，杀人犯又再次出现了。

第三集：《Hassun》

汉尼拔与威拉的关系日益紧张，威拉开始怀疑汉尼拔的真实身份。在此时，一名被汉尼拔杀害的人的家属找到了威拉，希望她能为他们伸张正义。

第四集：《Takiawase》

威拉开始在自己的梦中看到了汉尼拔的真面目。同时，两个人开始调查一个以人体器官为食的杀人犯。

第五集：《Mukōzuke》

汉尼拔开始揭露他的真实身份，同时，威拉也开始明白自己的真正使命。两个人一起追查一名性格极为奇怪的杀人犯。

第六集：《Futamono》

汉尼拔和威拉一起调查一名杀人犯，这名犯人喜欢在人体内注入蜜蜂的毒液，然后将其放在公共场所。

第七集：《Yakimono》

汉尼拔和威拉一起追查一名以烧烤为乐的杀人犯。就在此时，威拉的恶梦似乎变得更加真实了。

第八集：《Su-zakana》

威拉被关押在一间监狱中，汉尼拔则开始帮助她逃脱。两个人一起追查一名杀人犯，但这名犯人的身份却非常神秘。

第九集：《Shiizakana》

威拉和汉尼拔一起追查一个以动物为食的杀人犯。这名犯人的行踪非常难以追踪，但是，两个人还是坚持不懈地追查下去。

第十集：《Naka-Choko》

威拉开始与杀人犯产生共鸣，她渐渐地开始理解杀人的快感。在此时，汉尼拔的真正目的也被揭露了出来。

第十一集：《Kō No Mono》

汉尼拔和威拉一起去调查一名以与自己相同的人为食的杀人犯。在此时，汉尼拔的过去也开始浮出水面。

第十二集：《Tome-wan》

汉尼拔被逮捕，而威拉也因为自己的行为而被关押。汉尼拔和威拉开始互相交换信息，希望能够一起逃脱这个囚笼。

第十三集：《Mizumono》

第二季最后一集，汉尼拔和威拉的命运开始交织在一起。他们一起面对一个极为危险的敌人，而这个敌人似乎早已经预料到了他们的一切行动。