国防大学和国防科技大学都是我国为了培养高素质军事人才而设立的高等军事院校。然而，两所大学在办学理念、专业设置、教学内容等方面存在一些不同。

首先，国防大学是全军唯一的综合性国防高等学府，其办学宗旨是培养具有高度政治素质和综合素质的军事指挥、管理和研究人才。而国防科技大学则是我国军事科技领域的重要基地，其办学宗旨是培养高水平的军事科研人才和高技能的工程技术人才。

其次，两所大学在专业设置上也存在差异。国防大学的专业涵盖了军事、管理、法律、外交等多个领域，主要包括指挥、管理、战略学、战役学、联合作战指挥等专业。而国防科技大学主要开设军事科学、工程领域的专业，如军事电子、航天工程、兵器科学与技术等。

最后，两所大学的教学内容也存在不同。国防大学以军事指挥、管理和研究为核心，通过教授军事战略、作战指挥、军事法律等课程，培养学生的军事指挥和管理能力。而国防科技大学则以军事科技为重点，通过教授数学、物理、电子技术、计算机技术等课程，培养学生的科技研发和工程应用能力。

综上所述，国防大学和国防科技大学在办学理念、专业设置、教学内容等方面都存在差异。两所大学各自发挥着在军事领域的重要作用，为我国培养了大量高素质的军事人才，为我国的国防事业做出了重要贡献。