高速公路应急车道是为紧急情况而设立的，通常情况下不允许车辆停放。但在某些特殊情况下，如车辆故障或紧急情况等，车辆可以在应急车道上停车。那么，停在应急车道上会不会被扣分呢？

首先，根据《道路交通安全法》的规定，非紧急情况下停车在高速公路应急车道上是违法行为，将会被处以罚款和扣分的处罚。因此，如果没有紧急情况或车辆故障，车辆停在应急车道上是不被允许的。

其次，如果车辆在应急车道上停车是因为故障或紧急情况，驾驶员应该尽快采取措施，如开启危险警示灯，使用三角警告牌等，以确保自身安全和其他车辆的安全。同时，驾驶员应该及时联系路政部门或拨打紧急救援电话，尽快排除故障或处理紧急情况。

总的来说，停在高速公路应急车道上是不被允许的，但在紧急情况下，车辆可以在应急车道上停车。同时，驾驶员应该及时采取措施保证自身安全和其他车辆的安全，并尽快处理故障或紧急情况。如果没有紧急情况或车辆故障的情况下停车在应急车道上，将会被处以罚款和扣分的处罚。