六三制和五四制是两种不同的中学教育制度，会考制度也不同。六三制是指初中三年，高中三年的教育制度，教育时间为六年。而五四制是指初中四年，高中两年的教育制度，教育时间为六年。

在会考制度方面，六三制和五四制也有较大的区别。六三制的会考在高三进行，考试科目包括语文、数学、外语、物理、化学、生物、历史、地理、政治等九门科目。而五四制的会考则在高二进行，科目包括语文、数学、英语、物理、化学、生物、历史、地理、公民与社会等九门科目。可以看出，五四制的会考取消了政治科目，增加了公民与社会科目，更加注重社会实践。

除了会考科目的不同之外，六三制和五四制在教学内容、课程设置等方面也有所不同。六三制更加注重基础知识的学习和掌握，强调学生的理论知识和学科基础。而五四制则更加注重实践能力和综合素质的培养，课程设置更加多元化，注重学生的个性发展和创新思维。

总的来说，六三制和五四制在教育制度和会考制度方面有较大的区别。这两种教育制度都有其优点和缺点，需要根据不同的社会环境和教育需求来选择适合的教育模式。