始祖马是一种已经灭绝的古老马种，其生存历史可以追溯到约5000万年前的古新世。与现代马相比，始祖马有着明显的差别。

首先，始祖马的体型较小，身高只有约30厘米，而现代马的身高通常在1.4到1.8米之间。其次，始祖马的牙齿和脚趾数目都比现代马多。始祖马的牙齿比现代马更短、更尖，适合于咀嚼草叶。而现代马的牙齿则更大、更坚硬，适合于吃草和谷物。

此外，始祖马和现代马在生活环境和行为习惯上也存在差别。始祖马生活在热带雨林中，喜欢在树上跑动。而现代马则更适应开阔的平原和草原，喜欢在大空间中奔跑。

总之，始祖马和现代马之间差别明显，这也反映了动物在不同环境中自然选择的结果。随着时间的推移，动物种群会逐渐演化，以适应环境的变化。