应用数学系是一门研究数学方法在实际问题中应用的学科，其研究内容包括数学模型的构建、数值计算方法的研究和分析，以及实际问题的数学建模和解决方案的设计等。在应用数学系的学习中，毕业论文是一个非常重要的环节，它既是对学生学习成果的考核，也是对学生在实际问题中解决能力的考验。

在应用数学系毕业论文中，学生需要选择一个实际问题，并将其抽象成一个数学模型，然后采用数学方法对模型进行分析和求解。例如，一个应用数学系毕业论文的主题可以是研究城市交通拥堵问题，学生可以将城市交通流量、道路拥堵程度等因素抽象成一个数学模型，然后采用流体力学、优化方法等数学工具对模型进行分析和求解，最终得出优化城市交通的方案。

在应用数学系毕业论文的撰写中，学生需要具备扎实的数学功底和较强的分析和解决问题的能力。同时，学生还需要具备一定的实践经验，能够将数学方法应用到实际问题中，并能够对解决方案进行有效的评估和改进。

总之，应用数学系毕业论文是学生在应用数学领域中的一次实践和考核，它不仅是对学生学习成果的考验，也是对学生解决实际问题能力的考验。通过毕业论文的撰写，学生不仅可以提升自己的数学能力和解决问题的能力，还可以为实际问题的解决做出一定的贡献。